Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med30Q9CQI9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med30Q9CQI9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med30Q9CQI9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med30Q9CQI9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med30Q9CQI9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Med30Q9CQI9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med30Q9CQI9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med30Q9CQI9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med30Q9CQI9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med30Q9CQI9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med30Q9CQI9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med30Q9CQI9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med30Q9CQI9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med30Q9CQI9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med30Q9CQI9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Med30Q9CQI9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Med30Q9CQI9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med30Q9CQI9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med30Q9CQI9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med30Q9CQI9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med30Q9CQI9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med30Q9CQI9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med30Q9CQI9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med30Q9CQI9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med30Q9CQI9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms