Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpa3Q9CQ71 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpa3Q9CQ71 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpa3Q9CQ71 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rpa3Q9CQ71 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rpa3Q9CQ71 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpa3Q9CQ71 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rpa3Q9CQ71 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpa3Q9CQ71 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rpa3Q9CQ71 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpa3Q9CQ71 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpa3Q9CQ71 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rpa3Q9CQ71 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpa3Q9CQ71 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpa3Q9CQ71 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpa3Q9CQ71 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpa3Q9CQ71 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rpa3Q9CQ71 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpa3Q9CQ71 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rpa3Q9CQ71 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpa3Q9CQ71 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rpa3Q9CQ71 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rpa3Q9CQ71 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpa3Q9CQ71 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rpa3Q9CQ71 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpa3Q9CQ71 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rpa3Q9CQ71 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rpa3Q9CQ71 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rpa3Q9CQ71 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpa3Q9CQ71 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpa3Q9CQ71 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rpa3Q9CQ71 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpa3Q9CQ71 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpa3Q9CQ71 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rpa3Q9CQ71 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rpa3Q9CQ71 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rpa3Q9CQ71 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpa3Q9CQ71 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpa3Q9CQ71 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpa3Q9CQ71 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rpa3Q9CQ71 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpa3Q9CQ71 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rpa3Q9CQ71 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpa3Q9CQ71 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rpa3Q9CQ71 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpa3Q9CQ71 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rpa3Q9CQ71 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpa3Q9CQ71 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpa3Q9CQ71 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpa3Q9CQ71 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpa3Q9CQ71 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rpa3Q9CQ71 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rpa3Q9CQ71 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpa3Q9CQ71 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpa3Q9CQ71 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms