Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med21Q9CQ39 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med21Q9CQ39 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med21Q9CQ39 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Med21Q9CQ39 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Med21Q9CQ39 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Med21Q9CQ39 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Med21Q9CQ39 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Med21Q9CQ39 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med21Q9CQ39 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med21Q9CQ39 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms