Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms