Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
StambpQ9CQ26 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
StambpQ9CQ26 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
StambpQ9CQ26 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
StambpQ9CQ26 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
StambpQ9CQ26 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
StambpQ9CQ26 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149 ms