Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnaseh2cQ9CQ18 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnaseh2cQ9CQ18 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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