Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB5

Gsdmc, Gasdermin-C, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmcQ99NB5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GsdmcQ99NB5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GsdmcQ99NB5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GsdmcQ99NB5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GsdmcQ99NB5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GsdmcQ99NB5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GsdmcQ99NB5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GsdmcQ99NB5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GsdmcQ99NB5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GsdmcQ99NB5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GsdmcQ99NB5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GsdmcQ99NB5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GsdmcQ99NB5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GsdmcQ99NB5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GsdmcQ99NB5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GsdmcQ99NB5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GsdmcQ99NB5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms