Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atoh8Q99NA2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atoh8Q99NA2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atoh8Q99NA2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atoh8Q99NA2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Atoh8Q99NA2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atoh8Q99NA2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atoh8Q99NA2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atoh8Q99NA2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atoh8Q99NA2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atoh8Q99NA2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atoh8Q99NA2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atoh8Q99NA2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atoh8Q99NA2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atoh8Q99NA2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Atoh8Q99NA2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atoh8Q99NA2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atoh8Q99NA2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atoh8Q99NA2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atoh8Q99NA2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atoh8Q99NA2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atoh8Q99NA2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Atoh8Q99NA2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atoh8Q99NA2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atoh8Q99NA2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atoh8Q99NA2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atoh8Q99NA2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atoh8Q99NA2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atoh8Q99NA2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atoh8Q99NA2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atoh8Q99NA2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atoh8Q99NA2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Atoh8Q99NA2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atoh8Q99NA2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atoh8Q99NA2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atoh8Q99NA2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atoh8Q99NA2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atoh8Q99NA2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atoh8Q99NA2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atoh8Q99NA2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atoh8Q99NA2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atoh8Q99NA2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atoh8Q99NA2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atoh8Q99NA2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atoh8Q99NA2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atoh8Q99NA2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atoh8Q99NA2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atoh8Q99NA2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atoh8Q99NA2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atoh8Q99NA2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atoh8Q99NA2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atoh8Q99NA2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atoh8Q99NA2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atoh8Q99NA2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atoh8Q99NA2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atoh8Q99NA2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atoh8Q99NA2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atoh8Q99NA2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atoh8Q99NA2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atoh8Q99NA2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms