Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
Prss29Q99MS4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
Prss29Q99MS4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
Prss29Q99MS4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,24■□□□□ 0,35
Prss29Q99MS4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,24■□□□□ 0,35
Prss29Q99MS4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17,23■□□□□ 0,35
Prss29Q99MS4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Prss29Q99MS4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
Prss29Q99MS4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17,22■□□□□ 0,35
Prss29Q99MS4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,22■□□□□ 0,35
Prss29Q99MS4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
Prss29Q99MS4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Prss29Q99MS4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17,21■□□□□ 0,35
Prss29Q99MS4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17,21■□□□□ 0,35
Prss29Q99MS4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17,21■□□□□ 0,35
Prss29Q99MS4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,2■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,19■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,19■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17,19■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17,19■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17,17■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,17■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,17■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,16■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,16■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17,16■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,15■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17,15■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,15■□□□□ 0,34
Prss29Q99MS4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,14■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17,13■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,13■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,13■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,12■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,12■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17,11■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17,11■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17,11■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,11■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,11■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17,1■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,1■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,09■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17,09■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17,09■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,09■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,08■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,33
Prss29Q99MS4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,08■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17,08■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,07■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17,07■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17,07■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17,06■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17,06■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,05■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17,04■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17,03■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17,03■□□□□ 0,32
Prss29Q99MS4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,5 ms