Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CalcbQ99MP3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CalcbQ99MP3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CalcbQ99MP3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CalcbQ99MP3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CalcbQ99MP3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CalcbQ99MP3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CalcbQ99MP3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CalcbQ99MP3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CalcbQ99MP3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CalcbQ99MP3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CalcbQ99MP3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CalcbQ99MP3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CalcbQ99MP3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CalcbQ99MP3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CalcbQ99MP3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CalcbQ99MP3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CalcbQ99MP3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CalcbQ99MP3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CalcbQ99MP3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CalcbQ99MP3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CalcbQ99MP3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CalcbQ99MP3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CalcbQ99MP3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CalcbQ99MP3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CalcbQ99MP3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CalcbQ99MP3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CalcbQ99MP3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CalcbQ99MP3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CalcbQ99MP3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CalcbQ99MP3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CalcbQ99MP3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CalcbQ99MP3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CalcbQ99MP3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CalcbQ99MP3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CalcbQ99MP3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CalcbQ99MP3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CalcbQ99MP3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CalcbQ99MP3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CalcbQ99MP3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CalcbQ99MP3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CalcbQ99MP3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CalcbQ99MP3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CalcbQ99MP3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CalcbQ99MP3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CalcbQ99MP3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CalcbQ99MP3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CalcbQ99MP3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CalcbQ99MP3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CalcbQ99MP3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CalcbQ99MP3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CalcbQ99MP3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CalcbQ99MP3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CalcbQ99MP3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CalcbQ99MP3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CalcbQ99MP3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CalcbQ99MP3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CalcbQ99MP3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CalcbQ99MP3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CalcbQ99MP3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CalcbQ99MP3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CalcbQ99MP3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CalcbQ99MP3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CalcbQ99MP3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CalcbQ99MP3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CalcbQ99MP3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms