Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkd1Q99MH6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkd1Q99MH6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkd1Q99MH6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkd1Q99MH6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkd1Q99MH6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkd1Q99MH6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkd1Q99MH6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkd1Q99MH6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkd1Q99MH6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkd1Q99MH6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkd1Q99MH6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkd1Q99MH6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkd1Q99MH6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkd1Q99MH6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nkd1Q99MH6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nkd1Q99MH6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nkd1Q99MH6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkd1Q99MH6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nkd1Q99MH6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkd1Q99MH6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkd1Q99MH6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkd1Q99MH6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkd1Q99MH6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkd1Q99MH6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkd1Q99MH6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkd1Q99MH6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkd1Q99MH6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkd1Q99MH6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkd1Q99MH6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkd1Q99MH6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkd1Q99MH6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms