Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gins4Q99LZ3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gins4Q99LZ3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gins4Q99LZ3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gins4Q99LZ3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gins4Q99LZ3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.2 ms