Protein–RNA interactions for Protein: Q99LP8

Yipf2, Protein YIPF2, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf2Q99LP8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf2Q99LP8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf2Q99LP8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Yipf2Q99LP8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf2Q99LP8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf2Q99LP8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Yipf2Q99LP8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf2Q99LP8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Yipf2Q99LP8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Yipf2Q99LP8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Yipf2Q99LP8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Yipf2Q99LP8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Yipf2Q99LP8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Yipf2Q99LP8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Yipf2Q99LP8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Yipf2Q99LP8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Yipf2Q99LP8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Yipf2Q99LP8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Yipf2Q99LP8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Yipf2Q99LP8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Yipf2Q99LP8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Yipf2Q99LP8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Yipf2Q99LP8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Yipf2Q99LP8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yipf2Q99LP8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yipf2Q99LP8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Yipf2Q99LP8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yipf2Q99LP8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yipf2Q99LP8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yipf2Q99LP8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yipf2Q99LP8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf2Q99LP8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf2Q99LP8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf2Q99LP8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf2Q99LP8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf2Q99LP8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf2Q99LP8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf2Q99LP8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf2Q99LP8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf2Q99LP8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf2Q99LP8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf2Q99LP8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf2Q99LP8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf2Q99LP8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf2Q99LP8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf2Q99LP8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf2Q99LP8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf2Q99LP8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf2Q99LP8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf2Q99LP8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf2Q99LP8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Yipf2Q99LP8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Yipf2Q99LP8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf2Q99LP8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf2Q99LP8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf2Q99LP8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf2Q99LP8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf2Q99LP8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf2Q99LP8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf2Q99LP8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Yipf2Q99LP8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Yipf2Q99LP8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Yipf2Q99LP8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Yipf2Q99LP8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Yipf2Q99LP8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Yipf2Q99LP8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms