Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rcbtb2Q99LJ7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rcbtb2Q99LJ7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rcbtb2Q99LJ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
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