Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cttnbp2nlQ99LJ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms