Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms