Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcc1Q99LI2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcc1Q99LI2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clcc1Q99LI2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clcc1Q99LI2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clcc1Q99LI2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clcc1Q99LI2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clcc1Q99LI2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms