Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prpf19Q99KP6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prpf19Q99KP6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Prpf19Q99KP6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf19Q99KP6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf19Q99KP6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf19Q99KP6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf19Q99KP6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prpf19Q99KP6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf19Q99KP6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf19Q99KP6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prpf19Q99KP6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prpf19Q99KP6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prpf19Q99KP6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf19Q99KP6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prpf19Q99KP6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf19Q99KP6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf19Q99KP6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf19Q99KP6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prpf19Q99KP6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf19Q99KP6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf19Q99KP6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prpf19Q99KP6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms