Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf112Q96DY5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf112Q96DY5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf112Q96DY5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf112Q96DY5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf112Q96DY5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf112Q96DY5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf112Q96DY5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf112Q96DY5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf112Q96DY5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf112Q96DY5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf112Q96DY5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf112Q96DY5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf112Q96DY5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf112Q96DY5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf112Q96DY5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf112Q96DY5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf112Q96DY5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf112Q96DY5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf112Q96DY5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf112Q96DY5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf112Q96DY5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf112Q96DY5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf112Q96DY5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf112Q96DY5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf112Q96DY5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf112Q96DY5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf112Q96DY5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf112Q96DY5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf112Q96DY5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf112Q96DY5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf112Q96DY5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf112Q96DY5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf112Q96DY5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf112Q96DY5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf112Q96DY5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf112Q96DY5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf112Q96DY5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf112Q96DY5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf112Q96DY5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf112Q96DY5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf112Q96DY5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf112Q96DY5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf112Q96DY5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf112Q96DY5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf112Q96DY5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf112Q96DY5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf112Q96DY5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf112Q96DY5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf112Q96DY5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rnf112Q96DY5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf112Q96DY5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rnf112Q96DY5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf112Q96DY5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf112Q96DY5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms