Protein–RNA interactions for Protein: Q924C6

Loxl4, Lysyl oxidase homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxl4Q924C6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Loxl4Q924C6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Loxl4Q924C6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Loxl4Q924C6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Loxl4Q924C6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Loxl4Q924C6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Loxl4Q924C6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Loxl4Q924C6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Loxl4Q924C6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Loxl4Q924C6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Loxl4Q924C6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Loxl4Q924C6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Loxl4Q924C6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Loxl4Q924C6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Loxl4Q924C6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Loxl4Q924C6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Loxl4Q924C6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Loxl4Q924C6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms