Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nrif1Q923B3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrif1Q923B3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrif1Q923B3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrif1Q923B3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nrif1Q923B3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nrif1Q923B3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nrif1Q923B3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nrif1Q923B3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nrif1Q923B3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nrif1Q923B3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrif1Q923B3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrif1Q923B3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrif1Q923B3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrif1Q923B3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrif1Q923B3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrif1Q923B3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrif1Q923B3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nrif1Q923B3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nrif1Q923B3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nrif1Q923B3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nrif1Q923B3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nrif1Q923B3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nrif1Q923B3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrif1Q923B3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrif1Q923B3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrif1Q923B3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrif1Q923B3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrif1Q923B3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrif1Q923B3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrif1Q923B3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrif1Q923B3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrif1Q923B3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrif1Q923B3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrif1Q923B3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrif1Q923B3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrif1Q923B3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrif1Q923B3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrif1Q923B3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrif1Q923B3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrif1Q923B3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrif1Q923B3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrif1Q923B3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrif1Q923B3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrif1Q923B3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrif1Q923B3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrif1Q923B3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrif1Q923B3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nrif1Q923B3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrif1Q923B3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrif1Q923B3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrif1Q923B3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrif1Q923B3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrif1Q923B3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nrif1Q923B3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrif1Q923B3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrif1Q923B3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrif1Q923B3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrif1Q923B3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrif1Q923B3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms