Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn1Q922Y1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn1Q922Y1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn1Q922Y1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn1Q922Y1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn1Q922Y1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn1Q922Y1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn1Q922Y1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn1Q922Y1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn1Q922Y1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn1Q922Y1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn1Q922Y1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn1Q922Y1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn1Q922Y1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn1Q922Y1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn1Q922Y1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ubxn1Q922Y1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubxn1Q922Y1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubxn1Q922Y1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubxn1Q922Y1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubxn1Q922Y1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn1Q922Y1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn1Q922Y1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn1Q922Y1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn1Q922Y1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn1Q922Y1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn1Q922Y1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn1Q922Y1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn1Q922Y1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn1Q922Y1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn1Q922Y1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn1Q922Y1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubxn1Q922Y1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ubxn1Q922Y1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn1Q922Y1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn1Q922Y1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn1Q922Y1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn1Q922Y1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn1Q922Y1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn1Q922Y1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn1Q922Y1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn1Q922Y1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn1Q922Y1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn1Q922Y1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn1Q922Y1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn1Q922Y1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn1Q922Y1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn1Q922Y1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn1Q922Y1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn1Q922Y1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms