Protein–RNA interactions for Protein: Q921U8

Smtn, Smoothelin, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmtnQ921U8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SmtnQ921U8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SmtnQ921U8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SmtnQ921U8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SmtnQ921U8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SmtnQ921U8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SmtnQ921U8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SmtnQ921U8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SmtnQ921U8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SmtnQ921U8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SmtnQ921U8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SmtnQ921U8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SmtnQ921U8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SmtnQ921U8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SmtnQ921U8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SmtnQ921U8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SmtnQ921U8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SmtnQ921U8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SmtnQ921U8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SmtnQ921U8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SmtnQ921U8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SmtnQ921U8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SmtnQ921U8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms