Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpe65Q91ZQ5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpe65Q91ZQ5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpe65Q91ZQ5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpe65Q91ZQ5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpe65Q91ZQ5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpe65Q91ZQ5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpe65Q91ZQ5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpe65Q91ZQ5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpe65Q91ZQ5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpe65Q91ZQ5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpe65Q91ZQ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpe65Q91ZQ5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpe65Q91ZQ5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpe65Q91ZQ5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpe65Q91ZQ5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpe65Q91ZQ5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpe65Q91ZQ5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpe65Q91ZQ5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpe65Q91ZQ5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpe65Q91ZQ5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpe65Q91ZQ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpe65Q91ZQ5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpe65Q91ZQ5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpe65Q91ZQ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpe65Q91ZQ5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpe65Q91ZQ5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpe65Q91ZQ5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpe65Q91ZQ5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpe65Q91ZQ5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpe65Q91ZQ5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpe65Q91ZQ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpe65Q91ZQ5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpe65Q91ZQ5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpe65Q91ZQ5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpe65Q91ZQ5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpe65Q91ZQ5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpe65Q91ZQ5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpe65Q91ZQ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpe65Q91ZQ5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpe65Q91ZQ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpe65Q91ZQ5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpe65Q91ZQ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpe65Q91ZQ5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpe65Q91ZQ5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpe65Q91ZQ5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpe65Q91ZQ5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpe65Q91ZQ5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpe65Q91ZQ5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpe65Q91ZQ5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpe65Q91ZQ5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpe65Q91ZQ5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpe65Q91ZQ5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpe65Q91ZQ5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpe65Q91ZQ5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpe65Q91ZQ5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms