Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx4Q91YJ2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx4Q91YJ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx4Q91YJ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx4Q91YJ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx4Q91YJ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx4Q91YJ2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx4Q91YJ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx4Q91YJ2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx4Q91YJ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx4Q91YJ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx4Q91YJ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx4Q91YJ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx4Q91YJ2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx4Q91YJ2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx4Q91YJ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx4Q91YJ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx4Q91YJ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx4Q91YJ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx4Q91YJ2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx4Q91YJ2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx4Q91YJ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx4Q91YJ2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx4Q91YJ2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms