Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Basp1Q91XV3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Basp1Q91XV3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Basp1Q91XV3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Basp1Q91XV3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Basp1Q91XV3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms