Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp3Q91W36 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp3Q91W36 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp3Q91W36 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp3Q91W36 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp3Q91W36 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp3Q91W36 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp3Q91W36 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp3Q91W36 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp3Q91W36 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp3Q91W36 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp3Q91W36 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp3Q91W36 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp3Q91W36 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp3Q91W36 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp3Q91W36 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp3Q91W36 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp3Q91W36 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp3Q91W36 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp3Q91W36 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp3Q91W36 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp3Q91W36 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp3Q91W36 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp3Q91W36 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp3Q91W36 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp3Q91W36 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp3Q91W36 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp3Q91W36 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp3Q91W36 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp3Q91W36 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp3Q91W36 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp3Q91W36 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp3Q91W36 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp3Q91W36 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp3Q91W36 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp3Q91W36 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp3Q91W36 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp3Q91W36 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp3Q91W36 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp3Q91W36 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp3Q91W36 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp3Q91W36 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp3Q91W36 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp3Q91W36 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp3Q91W36 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp3Q91W36 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp3Q91W36 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp3Q91W36 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp3Q91W36 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp3Q91W36 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp3Q91W36 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp3Q91W36 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp3Q91W36 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp3Q91W36 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp3Q91W36 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp3Q91W36 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp3Q91W36 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp3Q91W36 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp3Q91W36 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp3Q91W36 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp3Q91W36 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp3Q91W36 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp3Q91W36 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp3Q91W36 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp3Q91W36 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp3Q91W36 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp3Q91W36 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp3Q91W36 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp3Q91W36 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp3Q91W36 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp3Q91W36 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp3Q91W36 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp3Q91W36 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp3Q91W36 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp3Q91W36 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp3Q91W36 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp3Q91W36 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp3Q91W36 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp3Q91W36 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp3Q91W36 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp3Q91W36 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp3Q91W36 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms