Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Capn8Q91VA3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn8Q91VA3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn8Q91VA3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Capn8Q91VA3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn8Q91VA3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn8Q91VA3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn8Q91VA3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn8Q91VA3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn8Q91VA3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn8Q91VA3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn8Q91VA3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn8Q91VA3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn8Q91VA3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn8Q91VA3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn8Q91VA3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn8Q91VA3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn8Q91VA3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn8Q91VA3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn8Q91VA3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn8Q91VA3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn8Q91VA3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn8Q91VA3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn8Q91VA3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn8Q91VA3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn8Q91VA3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn8Q91VA3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn8Q91VA3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn8Q91VA3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn8Q91VA3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn8Q91VA3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn8Q91VA3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn8Q91VA3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn8Q91VA3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn8Q91VA3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn8Q91VA3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms