Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vsx1Q91V10 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vsx1Q91V10 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vsx1Q91V10 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vsx1Q91V10 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vsx1Q91V10 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vsx1Q91V10 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vsx1Q91V10 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vsx1Q91V10 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vsx1Q91V10 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vsx1Q91V10 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vsx1Q91V10 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vsx1Q91V10 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vsx1Q91V10 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vsx1Q91V10 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vsx1Q91V10 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vsx1Q91V10 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vsx1Q91V10 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vsx1Q91V10 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vsx1Q91V10 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vsx1Q91V10 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vsx1Q91V10 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vsx1Q91V10 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vsx1Q91V10 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vsx1Q91V10 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vsx1Q91V10 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vsx1Q91V10 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vsx1Q91V10 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vsx1Q91V10 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vsx1Q91V10 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms