Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RestQ8VIG1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RestQ8VIG1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RestQ8VIG1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RestQ8VIG1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RestQ8VIG1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RestQ8VIG1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RestQ8VIG1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RestQ8VIG1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RestQ8VIG1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RestQ8VIG1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RestQ8VIG1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RestQ8VIG1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RestQ8VIG1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RestQ8VIG1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RestQ8VIG1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RestQ8VIG1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RestQ8VIG1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RestQ8VIG1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RestQ8VIG1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RestQ8VIG1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RestQ8VIG1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RestQ8VIG1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RestQ8VIG1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RestQ8VIG1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RestQ8VIG1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RestQ8VIG1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RestQ8VIG1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RestQ8VIG1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RestQ8VIG1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RestQ8VIG1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RestQ8VIG1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RestQ8VIG1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RestQ8VIG1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RestQ8VIG1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RestQ8VIG1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RestQ8VIG1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RestQ8VIG1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RestQ8VIG1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RestQ8VIG1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RestQ8VIG1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RestQ8VIG1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RestQ8VIG1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RestQ8VIG1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RestQ8VIG1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RestQ8VIG1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RestQ8VIG1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RestQ8VIG1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RestQ8VIG1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RestQ8VIG1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RestQ8VIG1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RestQ8VIG1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RestQ8VIG1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RestQ8VIG1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RestQ8VIG1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RestQ8VIG1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RestQ8VIG1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RestQ8VIG1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RestQ8VIG1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RestQ8VIG1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RestQ8VIG1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RestQ8VIG1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RestQ8VIG1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 360.3 ms