Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM1

Rnf130, E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf130Q8VEM1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf130Q8VEM1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf130Q8VEM1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf130Q8VEM1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf130Q8VEM1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf130Q8VEM1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf130Q8VEM1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf130Q8VEM1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf130Q8VEM1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf130Q8VEM1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf130Q8VEM1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf130Q8VEM1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf130Q8VEM1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf130Q8VEM1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf130Q8VEM1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf130Q8VEM1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf130Q8VEM1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rnf130Q8VEM1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf130Q8VEM1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf130Q8VEM1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf130Q8VEM1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf130Q8VEM1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf130Q8VEM1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf130Q8VEM1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf130Q8VEM1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf130Q8VEM1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf130Q8VEM1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf130Q8VEM1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf130Q8VEM1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf130Q8VEM1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf130Q8VEM1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf130Q8VEM1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf130Q8VEM1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf130Q8VEM1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf130Q8VEM1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms