Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Cul7Q8VE73 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Cul7Q8VE73 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Cul7Q8VE73 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Cul7Q8VE73 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Cul7Q8VE73 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC36,95■■■■□ 3,51
Cul7Q8VE73 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Cul7Q8VE73 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Cul7Q8VE73 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Cul7Q8VE73 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Cul7Q8VE73 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Cul7Q8VE73 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Cul7Q8VE73 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Cul7Q8VE73 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36,9■■■■□ 3,5
Cul7Q8VE73 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,9■■■■□ 3,5
Cul7Q8VE73 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36,9■■■■□ 3,5
Cul7Q8VE73 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Cul7Q8VE73 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,89■■■■□ 3,5
Cul7Q8VE73 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,49
Cul7Q8VE73 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Cul7Q8VE73 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36,86■■■■□ 3,49
Cul7Q8VE73 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC36,85■■■■□ 3,49
Cul7Q8VE73 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC36,85■■■■□ 3,49
Cul7Q8VE73 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Cul7Q8VE73 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Cul7Q8VE73 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Cul7Q8VE73 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Cul7Q8VE73 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36,81■■■■□ 3,48
Cul7Q8VE73 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
Cul7Q8VE73 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Cul7Q8VE73 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,8■■■■□ 3,48
Cul7Q8VE73 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Cul7Q8VE73 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Cul7Q8VE73 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,77■■■■□ 3,48
Cul7Q8VE73 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Cul7Q8VE73 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Cul7Q8VE73 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC36,74■■■■□ 3,47
Cul7Q8VE73 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36,74■■■■□ 3,47
Cul7Q8VE73 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Cul7Q8VE73 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36,72■■■■□ 3,47
Cul7Q8VE73 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36,72■■■■□ 3,47
Cul7Q8VE73 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36,71■■■■□ 3,47
Cul7Q8VE73 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC36,7■■■■□ 3,47
Cul7Q8VE73 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36,67■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC36,66■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC36,65■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36,65■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Cul7Q8VE73 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36,63■■■■□ 3,45
Cul7Q8VE73 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
Cul7Q8VE73 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Cul7Q8VE73 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Cul7Q8VE73 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36,59■■■■□ 3,45
Cul7Q8VE73 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC36,59■■■■□ 3,45
Cul7Q8VE73 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC36,58■■■■□ 3,45
Cul7Q8VE73 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Cul7Q8VE73 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Cul7Q8VE73 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Cul7Q8VE73 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36,57■■■■□ 3,44
Cul7Q8VE73 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC36,56■■■■□ 3,44
Cul7Q8VE73 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Cul7Q8VE73 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,56■■■■□ 3,44
Cul7Q8VE73 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36,55■■■■□ 3,44
Cul7Q8VE73 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Cul7Q8VE73 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36,54■■■■□ 3,44
Cul7Q8VE73 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Cul7Q8VE73 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Cul7Q8VE73 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,53■■■■□ 3,44
Cul7Q8VE73 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC36,51■■■■□ 3,44
Cul7Q8VE73 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36,51■■■■□ 3,44
Cul7Q8VE73 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Cul7Q8VE73 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,5■■■■□ 3,43
Cul7Q8VE73 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Cul7Q8VE73 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Cul7Q8VE73 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,48■■■■□ 3,43
Cul7Q8VE73 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC36,48■■■■□ 3,43
Cul7Q8VE73 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,48■■■■□ 3,43
Cul7Q8VE73 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Cul7Q8VE73 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Cul7Q8VE73 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Cul7Q8VE73 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Cul7Q8VE73 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36,46■■■■□ 3,43
Cul7Q8VE73 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Cul7Q8VE73 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Cul7Q8VE73 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36,45■■■■□ 3,43
Cul7Q8VE73 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms