Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
SnrkQ8VDU5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
SnrkQ8VDU5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29,79■■■□□ 2,36
SnrkQ8VDU5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
SnrkQ8VDU5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29,78■■■□□ 2,36
SnrkQ8VDU5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
SnrkQ8VDU5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
SnrkQ8VDU5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29,76■■■□□ 2,35
SnrkQ8VDU5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
SnrkQ8VDU5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29,73■■■□□ 2,35
SnrkQ8VDU5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
SnrkQ8VDU5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
SnrkQ8VDU5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
SnrkQ8VDU5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
SnrkQ8VDU5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29,71■■■□□ 2,35
SnrkQ8VDU5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
SnrkQ8VDU5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
SnrkQ8VDU5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29,7■■■□□ 2,35
SnrkQ8VDU5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
SnrkQ8VDU5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29,69■■■□□ 2,34
SnrkQ8VDU5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
SnrkQ8VDU5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
SnrkQ8VDU5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
SnrkQ8VDU5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
SnrkQ8VDU5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
SnrkQ8VDU5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
SnrkQ8VDU5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
SnrkQ8VDU5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
SnrkQ8VDU5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29,67■■■□□ 2,34
SnrkQ8VDU5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
SnrkQ8VDU5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
SnrkQ8VDU5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29,64■■■□□ 2,34
SnrkQ8VDU5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
SnrkQ8VDU5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
SnrkQ8VDU5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,63■■■□□ 2,33
SnrkQ8VDU5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
SnrkQ8VDU5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
SnrkQ8VDU5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
SnrkQ8VDU5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
SnrkQ8VDU5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
SnrkQ8VDU5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
SnrkQ8VDU5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
SnrkQ8VDU5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
SnrkQ8VDU5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29,57■■■□□ 2,32
SnrkQ8VDU5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29,57■■■□□ 2,32
SnrkQ8VDU5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
SnrkQ8VDU5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
SnrkQ8VDU5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
SnrkQ8VDU5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
SnrkQ8VDU5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
SnrkQ8VDU5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
SnrkQ8VDU5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
SnrkQ8VDU5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
SnrkQ8VDU5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
SnrkQ8VDU5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
SnrkQ8VDU5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
SnrkQ8VDU5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
SnrkQ8VDU5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
SnrkQ8VDU5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29,53■■■□□ 2,32
SnrkQ8VDU5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
SnrkQ8VDU5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
SnrkQ8VDU5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
SnrkQ8VDU5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
SnrkQ8VDU5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
SnrkQ8VDU5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
SnrkQ8VDU5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
SnrkQ8VDU5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
SnrkQ8VDU5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
SnrkQ8VDU5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29,47■■■□□ 2,31
SnrkQ8VDU5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,47■■■□□ 2,31
SnrkQ8VDU5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
SnrkQ8VDU5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
SnrkQ8VDU5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
SnrkQ8VDU5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
SnrkQ8VDU5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,43■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29,4■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
SnrkQ8VDU5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
SnrkQ8VDU5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
SnrkQ8VDU5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
SnrkQ8VDU5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
SnrkQ8VDU5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
SnrkQ8VDU5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
SnrkQ8VDU5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
SnrkQ8VDU5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms