Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rprd1aQ8VDS4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rprd1aQ8VDS4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rprd1aQ8VDS4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rprd1aQ8VDS4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rprd1aQ8VDS4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd1aQ8VDS4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd1aQ8VDS4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd1aQ8VDS4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd1aQ8VDS4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd1aQ8VDS4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd1aQ8VDS4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd1aQ8VDS4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd1aQ8VDS4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rprd1aQ8VDS4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rprd1aQ8VDS4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rprd1aQ8VDS4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rprd1aQ8VDS4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rprd1aQ8VDS4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rprd1aQ8VDS4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rprd1aQ8VDS4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rprd1aQ8VDS4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rprd1aQ8VDS4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rprd1aQ8VDS4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd1aQ8VDS4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd1aQ8VDS4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd1aQ8VDS4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rprd1aQ8VDS4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd1aQ8VDS4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rprd1aQ8VDS4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rprd1aQ8VDS4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rprd1aQ8VDS4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rprd1aQ8VDS4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rprd1aQ8VDS4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rprd1aQ8VDS4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rprd1aQ8VDS4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rprd1aQ8VDS4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rprd1aQ8VDS4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rprd1aQ8VDS4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rprd1aQ8VDS4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rprd1aQ8VDS4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rprd1aQ8VDS4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rprd1aQ8VDS4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rprd1aQ8VDS4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rprd1aQ8VDS4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rprd1aQ8VDS4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rprd1aQ8VDS4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rprd1aQ8VDS4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rprd1aQ8VDS4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rprd1aQ8VDS4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rprd1aQ8VDS4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rprd1aQ8VDS4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd1aQ8VDS4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd1aQ8VDS4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rprd1aQ8VDS4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd1aQ8VDS4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd1aQ8VDS4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd1aQ8VDS4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd1aQ8VDS4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd1aQ8VDS4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd1aQ8VDS4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd1aQ8VDS4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rprd1aQ8VDS4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rprd1aQ8VDS4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rprd1aQ8VDS4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rprd1aQ8VDS4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rprd1aQ8VDS4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rprd1aQ8VDS4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rprd1aQ8VDS4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rprd1aQ8VDS4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms