Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Uhrf1Q8VDF2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Uhrf1Q8VDF2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Uhrf1Q8VDF2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1Q8VDF2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1Q8VDF2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Uhrf1Q8VDF2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Uhrf1Q8VDF2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1Q8VDF2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1Q8VDF2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1Q8VDF2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Uhrf1Q8VDF2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1Q8VDF2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1Q8VDF2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1Q8VDF2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1Q8VDF2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Uhrf1Q8VDF2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1Q8VDF2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1Q8VDF2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Uhrf1Q8VDF2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Uhrf1Q8VDF2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uhrf1Q8VDF2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uhrf1Q8VDF2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Uhrf1Q8VDF2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1Q8VDF2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1Q8VDF2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1Q8VDF2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1Q8VDF2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1Q8VDF2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1Q8VDF2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1Q8VDF2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1Q8VDF2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1Q8VDF2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1Q8VDF2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1Q8VDF2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1Q8VDF2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uhrf1Q8VDF2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uhrf1Q8VDF2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1Q8VDF2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1Q8VDF2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1Q8VDF2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1Q8VDF2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Uhrf1Q8VDF2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uhrf1Q8VDF2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uhrf1Q8VDF2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uhrf1Q8VDF2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uhrf1Q8VDF2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Uhrf1Q8VDF2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Uhrf1Q8VDF2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uhrf1Q8VDF2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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