Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ubxn4Q8VCH8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ubxn4Q8VCH8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ubxn4Q8VCH8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ubxn4Q8VCH8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ubxn4Q8VCH8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ubxn4Q8VCH8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ubxn4Q8VCH8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ubxn4Q8VCH8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ubxn4Q8VCH8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ubxn4Q8VCH8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ubxn4Q8VCH8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ubxn4Q8VCH8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms