Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH2

Cd300ld, CMRF35-like molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ldQ8VCH2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cd300ldQ8VCH2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cd300ldQ8VCH2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd300ldQ8VCH2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cd300ldQ8VCH2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd300ldQ8VCH2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd300ldQ8VCH2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd300ldQ8VCH2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd300ldQ8VCH2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd300ldQ8VCH2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd300ldQ8VCH2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd300ldQ8VCH2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd300ldQ8VCH2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd300ldQ8VCH2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd300ldQ8VCH2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd300ldQ8VCH2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd300ldQ8VCH2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd300ldQ8VCH2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd300ldQ8VCH2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd300ldQ8VCH2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd300ldQ8VCH2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd300ldQ8VCH2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd300ldQ8VCH2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd300ldQ8VCH2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd300ldQ8VCH2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd300ldQ8VCH2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd300ldQ8VCH2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd300ldQ8VCH2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd300ldQ8VCH2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd300ldQ8VCH2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd300ldQ8VCH2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd300ldQ8VCH2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd300ldQ8VCH2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd300ldQ8VCH2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd300ldQ8VCH2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd300ldQ8VCH2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd300ldQ8VCH2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd300ldQ8VCH2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd300ldQ8VCH2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd300ldQ8VCH2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd300ldQ8VCH2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd300ldQ8VCH2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd300ldQ8VCH2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cd300ldQ8VCH2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd300ldQ8VCH2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd300ldQ8VCH2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd300ldQ8VCH2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd300ldQ8VCH2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd300ldQ8VCH2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd300ldQ8VCH2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd300ldQ8VCH2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd300ldQ8VCH2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd300ldQ8VCH2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd300ldQ8VCH2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd300ldQ8VCH2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd300ldQ8VCH2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd300ldQ8VCH2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd300ldQ8VCH2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd300ldQ8VCH2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd300ldQ8VCH2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd300ldQ8VCH2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms