Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmx1Q8VBT0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmx1Q8VBT0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmx1Q8VBT0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmx1Q8VBT0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmx1Q8VBT0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmx1Q8VBT0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmx1Q8VBT0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmx1Q8VBT0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmx1Q8VBT0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmx1Q8VBT0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmx1Q8VBT0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmx1Q8VBT0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmx1Q8VBT0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmx1Q8VBT0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmx1Q8VBT0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmx1Q8VBT0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmx1Q8VBT0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmx1Q8VBT0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmx1Q8VBT0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmx1Q8VBT0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmx1Q8VBT0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmx1Q8VBT0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmx1Q8VBT0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmx1Q8VBT0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmx1Q8VBT0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmx1Q8VBT0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmx1Q8VBT0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmx1Q8VBT0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmx1Q8VBT0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmx1Q8VBT0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmx1Q8VBT0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmx1Q8VBT0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmx1Q8VBT0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmx1Q8VBT0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmx1Q8VBT0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmx1Q8VBT0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmx1Q8VBT0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmx1Q8VBT0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmx1Q8VBT0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmx1Q8VBT0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmx1Q8VBT0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmx1Q8VBT0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmx1Q8VBT0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tmx1Q8VBT0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmx1Q8VBT0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmx1Q8VBT0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmx1Q8VBT0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmx1Q8VBT0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmx1Q8VBT0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmx1Q8VBT0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmx1Q8VBT0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmx1Q8VBT0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmx1Q8VBT0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmx1Q8VBT0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmx1Q8VBT0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmx1Q8VBT0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmx1Q8VBT0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms