Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup35Q8R4R6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup35Q8R4R6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nup35Q8R4R6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nup35Q8R4R6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nup35Q8R4R6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup35Q8R4R6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup35Q8R4R6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nup35Q8R4R6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup35Q8R4R6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup35Q8R4R6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup35Q8R4R6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup35Q8R4R6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nup35Q8R4R6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup35Q8R4R6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup35Q8R4R6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nup35Q8R4R6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup35Q8R4R6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup35Q8R4R6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nup35Q8R4R6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup35Q8R4R6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nup35Q8R4R6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nup35Q8R4R6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup35Q8R4R6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nup35Q8R4R6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup35Q8R4R6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nup35Q8R4R6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 742.3 ms