Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gtf3c5Q8R2T8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gtf3c5Q8R2T8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf3c5Q8R2T8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf3c5Q8R2T8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtf3c5Q8R2T8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtf3c5Q8R2T8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtf3c5Q8R2T8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtf3c5Q8R2T8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf3c5Q8R2T8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf3c5Q8R2T8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtf3c5Q8R2T8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtf3c5Q8R2T8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtf3c5Q8R2T8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtf3c5Q8R2T8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf3c5Q8R2T8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf3c5Q8R2T8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf3c5Q8R2T8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf3c5Q8R2T8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gtf3c5Q8R2T8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtf3c5Q8R2T8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtf3c5Q8R2T8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtf3c5Q8R2T8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf3c5Q8R2T8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gtf3c5Q8R2T8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf3c5Q8R2T8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf3c5Q8R2T8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf3c5Q8R2T8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gtf3c5Q8R2T8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gtf3c5Q8R2T8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtf3c5Q8R2T8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gtf3c5Q8R2T8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gtf3c5Q8R2T8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtf3c5Q8R2T8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf3c5Q8R2T8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf3c5Q8R2T8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf3c5Q8R2T8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gtf3c5Q8R2T8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf3c5Q8R2T8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms