Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2G6

Ccdc80, Coiled-coil domain-containing protein 80, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc80Q8R2G6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc80Q8R2G6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc80Q8R2G6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc80Q8R2G6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc80Q8R2G6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc80Q8R2G6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc80Q8R2G6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc80Q8R2G6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc80Q8R2G6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc80Q8R2G6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc80Q8R2G6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms