Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl47Q8K2Y7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl47Q8K2Y7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Mrpl47Q8K2Y7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl47Q8K2Y7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl47Q8K2Y7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms