Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hacd3Q8K2C9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hacd3Q8K2C9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hacd3Q8K2C9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hacd3Q8K2C9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hacd3Q8K2C9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hacd3Q8K2C9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hacd3Q8K2C9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hacd3Q8K2C9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hacd3Q8K2C9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hacd3Q8K2C9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hacd3Q8K2C9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hacd3Q8K2C9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hacd3Q8K2C9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hacd3Q8K2C9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hacd3Q8K2C9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hacd3Q8K2C9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hacd3Q8K2C9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hacd3Q8K2C9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hacd3Q8K2C9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hacd3Q8K2C9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hacd3Q8K2C9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hacd3Q8K2C9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hacd3Q8K2C9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hacd3Q8K2C9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hacd3Q8K2C9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hacd3Q8K2C9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hacd3Q8K2C9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hacd3Q8K2C9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hacd3Q8K2C9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hacd3Q8K2C9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hacd3Q8K2C9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hacd3Q8K2C9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hacd3Q8K2C9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms