Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfip2Q8K221 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfip2Q8K221 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfip2Q8K221 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arfip2Q8K221 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arfip2Q8K221 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arfip2Q8K221 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arfip2Q8K221 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arfip2Q8K221 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arfip2Q8K221 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arfip2Q8K221 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arfip2Q8K221 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arfip2Q8K221 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfip2Q8K221 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfip2Q8K221 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfip2Q8K221 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfip2Q8K221 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfip2Q8K221 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfip2Q8K221 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfip2Q8K221 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfip2Q8K221 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfip2Q8K221 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfip2Q8K221 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfip2Q8K221 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfip2Q8K221 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arfip2Q8K221 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arfip2Q8K221 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfip2Q8K221 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfip2Q8K221 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfip2Q8K221 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfip2Q8K221 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfip2Q8K221 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfip2Q8K221 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfip2Q8K221 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfip2Q8K221 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfip2Q8K221 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfip2Q8K221 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arfip2Q8K221 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arfip2Q8K221 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfip2Q8K221 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfip2Q8K221 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfip2Q8K221 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfip2Q8K221 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfip2Q8K221 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arfip2Q8K221 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arfip2Q8K221 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms