Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR4

Slc1a7, Excitatory amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a7Q8JZR4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc1a7Q8JZR4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc1a7Q8JZR4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc1a7Q8JZR4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc1a7Q8JZR4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc1a7Q8JZR4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms