Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ91

Cd209b, CD209 antigen-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd209bQ8CJ91 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd209bQ8CJ91 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd209bQ8CJ91 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd209bQ8CJ91 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cd209bQ8CJ91 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cd209bQ8CJ91 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd209bQ8CJ91 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd209bQ8CJ91 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd209bQ8CJ91 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cd209bQ8CJ91 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd209bQ8CJ91 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd209bQ8CJ91 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd209bQ8CJ91 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd209bQ8CJ91 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd209bQ8CJ91 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd209bQ8CJ91 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd209bQ8CJ91 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd209bQ8CJ91 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd209bQ8CJ91 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd209bQ8CJ91 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cd209bQ8CJ91 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cd209bQ8CJ91 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd209bQ8CJ91 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd209bQ8CJ91 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cd209bQ8CJ91 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cd209bQ8CJ91 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd209bQ8CJ91 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd209bQ8CJ91 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd209bQ8CJ91 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd209bQ8CJ91 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cd209bQ8CJ91 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd209bQ8CJ91 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd209bQ8CJ91 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd209bQ8CJ91 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd209bQ8CJ91 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cd209bQ8CJ91 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cd209bQ8CJ91 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms