Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LgsnQ8CIX8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LgsnQ8CIX8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LgsnQ8CIX8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LgsnQ8CIX8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LgsnQ8CIX8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LgsnQ8CIX8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LgsnQ8CIX8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LgsnQ8CIX8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LgsnQ8CIX8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LgsnQ8CIX8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LgsnQ8CIX8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LgsnQ8CIX8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LgsnQ8CIX8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LgsnQ8CIX8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LgsnQ8CIX8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LgsnQ8CIX8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LgsnQ8CIX8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LgsnQ8CIX8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LgsnQ8CIX8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LgsnQ8CIX8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LgsnQ8CIX8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LgsnQ8CIX8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LgsnQ8CIX8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LgsnQ8CIX8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LgsnQ8CIX8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LgsnQ8CIX8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LgsnQ8CIX8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LgsnQ8CIX8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LgsnQ8CIX8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LgsnQ8CIX8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LgsnQ8CIX8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LgsnQ8CIX8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LgsnQ8CIX8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LgsnQ8CIX8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LgsnQ8CIX8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LgsnQ8CIX8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LgsnQ8CIX8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LgsnQ8CIX8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LgsnQ8CIX8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LgsnQ8CIX8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LgsnQ8CIX8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LgsnQ8CIX8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LgsnQ8CIX8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LgsnQ8CIX8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LgsnQ8CIX8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LgsnQ8CIX8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LgsnQ8CIX8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LgsnQ8CIX8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LgsnQ8CIX8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms