Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TwnkQ8CIW5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TwnkQ8CIW5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TwnkQ8CIW5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TwnkQ8CIW5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TwnkQ8CIW5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TwnkQ8CIW5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TwnkQ8CIW5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TwnkQ8CIW5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TwnkQ8CIW5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TwnkQ8CIW5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TwnkQ8CIW5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TwnkQ8CIW5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TwnkQ8CIW5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TwnkQ8CIW5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TwnkQ8CIW5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TwnkQ8CIW5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TwnkQ8CIW5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TwnkQ8CIW5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms