Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIM1

Lrrc45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc45Q8CIM1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc45Q8CIM1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc45Q8CIM1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc45Q8CIM1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc45Q8CIM1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc45Q8CIM1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrc45Q8CIM1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc45Q8CIM1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc45Q8CIM1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lrrc45Q8CIM1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc45Q8CIM1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc45Q8CIM1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc45Q8CIM1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms