Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIF6

Sidt2, SID1 transmembrane family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sidt2Q8CIF6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sidt2Q8CIF6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sidt2Q8CIF6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sidt2Q8CIF6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sidt2Q8CIF6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sidt2Q8CIF6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sidt2Q8CIF6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms