Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ep400Q8CHI8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ep400Q8CHI8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ep400Q8CHI8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ep400Q8CHI8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ep400Q8CHI8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ep400Q8CHI8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ep400Q8CHI8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ep400Q8CHI8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ep400Q8CHI8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ep400Q8CHI8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ep400Q8CHI8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ep400Q8CHI8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ep400Q8CHI8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ep400Q8CHI8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ep400Q8CHI8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ep400Q8CHI8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ep400Q8CHI8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ep400Q8CHI8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ep400Q8CHI8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ep400Q8CHI8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ep400Q8CHI8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ep400Q8CHI8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ep400Q8CHI8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ep400Q8CHI8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ep400Q8CHI8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ep400Q8CHI8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ep400Q8CHI8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ep400Q8CHI8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ep400Q8CHI8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ep400Q8CHI8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ep400Q8CHI8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ep400Q8CHI8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ep400Q8CHI8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ep400Q8CHI8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
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