Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Setd1bQ8CFT2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Setd1bQ8CFT2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Setd1bQ8CFT2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Setd1bQ8CFT2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Setd1bQ8CFT2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
Setd1bQ8CFT2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Setd1bQ8CFT2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Setd1bQ8CFT2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Setd1bQ8CFT2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Setd1bQ8CFT2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Setd1bQ8CFT2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Setd1bQ8CFT2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Setd1bQ8CFT2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Setd1bQ8CFT2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Setd1bQ8CFT2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Setd1bQ8CFT2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Setd1bQ8CFT2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Setd1bQ8CFT2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Setd1bQ8CFT2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Setd1bQ8CFT2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Setd1bQ8CFT2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Setd1bQ8CFT2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Setd1bQ8CFT2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Setd1bQ8CFT2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Setd1bQ8CFT2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Setd1bQ8CFT2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Setd1bQ8CFT2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Setd1bQ8CFT2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Setd1bQ8CFT2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Setd1bQ8CFT2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Setd1bQ8CFT2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Setd1bQ8CFT2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Setd1bQ8CFT2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Setd1bQ8CFT2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Setd1bQ8CFT2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Setd1bQ8CFT2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Setd1bQ8CFT2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Setd1bQ8CFT2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Setd1bQ8CFT2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Setd1bQ8CFT2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Setd1bQ8CFT2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Setd1bQ8CFT2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Setd1bQ8CFT2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Setd1bQ8CFT2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Setd1bQ8CFT2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Setd1bQ8CFT2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Setd1bQ8CFT2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Setd1bQ8CFT2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Setd1bQ8CFT2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Setd1bQ8CFT2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Setd1bQ8CFT2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Setd1bQ8CFT2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Setd1bQ8CFT2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Setd1bQ8CFT2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Setd1bQ8CFT2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Setd1bQ8CFT2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Setd1bQ8CFT2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Setd1bQ8CFT2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Setd1bQ8CFT2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Setd1bQ8CFT2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Setd1bQ8CFT2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Setd1bQ8CFT2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Setd1bQ8CFT2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Setd1bQ8CFT2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Setd1bQ8CFT2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Setd1bQ8CFT2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Setd1bQ8CFT2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Setd1bQ8CFT2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Setd1bQ8CFT2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Setd1bQ8CFT2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Setd1bQ8CFT2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Setd1bQ8CFT2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Setd1bQ8CFT2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Setd1bQ8CFT2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Setd1bQ8CFT2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Setd1bQ8CFT2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Setd1bQ8CFT2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Setd1bQ8CFT2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Setd1bQ8CFT2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Setd1bQ8CFT2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Setd1bQ8CFT2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Setd1bQ8CFT2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Setd1bQ8CFT2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Setd1bQ8CFT2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Setd1bQ8CFT2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Setd1bQ8CFT2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Setd1bQ8CFT2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Setd1bQ8CFT2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
Setd1bQ8CFT2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Setd1bQ8CFT2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Setd1bQ8CFT2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Setd1bQ8CFT2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Setd1bQ8CFT2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Setd1bQ8CFT2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Setd1bQ8CFT2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Setd1bQ8CFT2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Setd1bQ8CFT2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Setd1bQ8CFT2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Setd1bQ8CFT2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms